Le opzioni del programma possono avere le seguenti impostazioni:
Registro dei messaggi cancellati
MMM può registrare i messaggi che sono stati cancellati automaticamente dai filtri. E' opportuno notare che i messaggi che sono stati cancellati manualmente non saranno registrati. Il file di registrazione si chiama msgdeleted.log e si trova nella stessa cartella di magic.exe. Si può cambiare la dimensione massima del file di registrazione, ma raggiunto questo limite la registrazione verrà troncata. Per evitare il troncamento automatico è sufficiente fissare il limite a Ø. In questo caso bisogna di tanto in tanto cancellare questo file manualmente.
Utilizzo di colori particolari per i messaggi degli "amici"
I messaggi i cui mittenti sono nell' elenco degli amici (friendlst.txt) possono essere evidenziati con colori particolari.
Consenti una sola esecuzione per volta
Questa opzione impedirà che venga avviata un'altra esecuzione di MMM; in questo caso, rieseguendo MMM, verrà portata in evidenza l'esecuzione già in corso.